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Tri :
Date de référencement
Editeur
Auteur
Titre
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L’Annotathon : une plate-forme collaborative d'annotation de séquences biologiques
[Ressource pédagogique]
Date de publication :
20081218 |
Auteur(s) :
Herrmann Carl |
Editeur(s) :
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique / Interstices |
Origine de la fiche :
Université Numérique Ingénierie et Technologie
La bioinformatique offre aux biologistes des outils informatiques de nouvelle génération.
Référencé le :
31-03-2021
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Analyser les génomes des océans
[Ressource pédagogique]
Date de publication :
20190905 |
Auteur(s) :
Peterlongo Pierre |
Editeur(s) :
Inria / Interstices |
Origine de la fiche :
Université Numérique Ingénierie et Technologie
Grâce aux techniques de séquençage de l’ADN, nous avons aujourd’hui les moyens technologiques de connaitre le génome des organismes vivants, le plancton des océans y compris. Mais est-ce si simple ? Comment extraire de l’information biologique de gigantesques masses de données contenant des fragments des génomes des organismes vivants dans les océans ? Comment développer un outil informatique pert...
Référencé le :
08-01-2020
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Histoire des idées
[Ressource pédagogique]
Date de publication :
20130321 |
Auteur(s) :
LAVELLE Christophe |
Origine de la fiche :
Canal-u.fr
Dans ce premier volet, Christophe Lavelle, chercheur au Muséum National d'Histoire Nurelle, nous expose les débats entre la génétique et l'épigénétique, ceux entre Larmarck et Darwin. Il nous parlera de l'histoire de l'ADN, de la différenctation cellualire, du paysage épigénétique. Enfin, il nous montera comment, d'Aristote à Morgan, le concept d'épigénétique s'est peu à peu dévoilé, et les défis
...
Référencé le :
29-11-2016
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De la création à l'évolution: l'invention de la biologie
[Ressource pédagogique]
Date de publication :
20130919 |
Auteur(s) :
LANGANEY André |
Origine de la fiche :
Canal-u.fr
Face à des dogmes religieux qui donnaient la
priorité à l’irrationnel et à des prêtres qui faisaient torturer et tuer ceux
qui n’y croyaient pas, la construction de la théorie de l’évolution fût lente
et souvent dramatique. C’est aujourd’hui le fondement incontournable de la
biologie, même si elle reste l’objet d’attaques frontales dans les théocraties
et aux Etats Unis. André Langaney, généticien...
Référencé le :
22-11-2016
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5.4. L’algorithme UPGMA
[Ressource pédagogique]
Date de publication :
20150601 |
Auteur(s) :
RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry |
Origine de la fiche :
Canal-u.fr
L'algorithme, que nous allons étudier pour la reconstruction d'arbres phylogénétiques à partir des distances, s'appelle UPGMA. Un nom plutôt compliqué pour une méthode qui est plutôt simple. Et même, on le verra trop simple. UPGMA signifie Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean. Nous allons voir au fur et à mesure, la signification dans l'exécution de l'algorithme de chacun de ces terme...
Référencé le :
25-10-2016
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3.3. À la recherche des codons start et stop
[Ressource pédagogique]
Date de publication :
20150601 |
Auteur(s) :
RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry |
Origine de la fiche :
Canal-u.fr
Nous avons écrit la structure, l'ossature d'un algorithme de prédiction de gènes dans un génome bactérien, en utilisant les principes que nous avions énoncés précédemment. Cet algorithme est incomplet puisque pour l'instant, nous avons repoussé l'écriture des 2 fonctions nécessaires à la recherche des occurrences des triplets Stop et Start. C'est donc ce que nous allons faire maintenant.
Comment ...
Référencé le :
25-10-2016
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3.1. Tous les gènes se terminent sur un codon stop
[Ressource pédagogique]
Date de publication :
20150601 |
Auteur(s) :
RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry |
Origine de la fiche :
Canal-u.fr
Une fois la séquence d'un génome complet obtenue, débute la phase d'annotation. L'annotation elle-même consiste tout d'abord à rechercher la localisation, c'est-à-dire la position des gènes sur cette séquence. Cette semaine, nous allons nous intéresser à la prédiction des gènes, nous allons étudier un algorithme de prédiction de gènes sur des séquences génomiques procaryotes, nous allons essayer d...
Référencé le :
25-10-2016
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2.8. Les technologies de séquençage de l’ADN
[Ressource pédagogique]
Date de publication :
20150601 |
Auteur(s) :
RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry |
Origine de la fiche :
Canal-u.fr
Nous parlons beaucoup dans ce cours de séquences génomiques ou séquences d'ADN, que nous voyons pour des raisons algorithmiques sous forme de chaînes de caractères. Comment ces séquences, ces chaînes de caractères, sont-elles obtenues ? D'une manière très imagée, il s'agit de lire la succession des nucléotides le long d'un brin d'ADN. Je dis imagé parce que cette lecture n'est pas une opération ex...
Référencé le :
25-10-2016
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2.3. Le code génétique
[Ressource pédagogique]
Date de publication :
20150601 |
Auteur(s) :
RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry |
Origine de la fiche :
Canal-u.fr
Gènes et protéines, mais qu'est-ce qu'une protéine ? Une protéine, c'est également une molécule qui est constituée d'une succession de ce que l'on appelle les acides aminés. C'est donc une chaîne d'acides aminés qui sont des motifs chimiques élémentaires. Il existe 20 acides aminés distincts. Chacun de ces acides aminés peut être désigné soit par son nom complet, soit par un nom à 3 lettres, soit ...
Référencé le :
25-10-2016
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2.2. Les gènes, de Mendel à la biologie moléculaire
[Ressource pédagogique]
Date de publication :
20150601 |
Auteur(s) :
RECHENMANN Francois, PARMENTELAT Thierry |
Origine de la fiche :
Canal-u.fr
La séquence de caractères est un bon modèle de l'ADN, un des modèles possibles de l'ADN et il est bon parce qu'il est utile. On va voir en particulier que ce modèle simple peut servir de support à de la prédiction de gènes. On va pouvoir grâce à ce modèle-là, avec les algorithmes appropriés, trouver les gènes sur l'ADN. Et donc, surtout, sur la séquence qui représente cet ADN.
Cette notion de gèn...
Référencé le :
25-10-2016
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