Université de Rennes 1 Impact de traitements antibiotiques sur la flore digestive du porcelet : Etude in vivo et développement d'une approche en système de fermentation in vitro Impact of antibiotics treatments on piglet gut microbiota: In vivo study and development of an in vitro fermentation system Microbiote intestinalantibiorésistancePigutIVM modèleporcelet Intestinal microbiotaantimicrobial resistancePigutIVM modelpiglet Flore intestinale Thèses et écrits académiques Résistance aux antibiotiques Thèses et écrits académiques Porcelets Thèses et écrits académiques Dans le contexte de l'antibiorésistance, l'objet de ce doctorat vise à évaluer l'impact d'antibiotiques sur le microbiote intestinal de porcelets. La colistine et le ceftiofur, pour lesquels les résistances incluent essentiellement et respectivement mutations chromosomiques et gènes plasmidiques, ont été utilisés. La colistine a significativement réduit la population des entérobactéries, mais aucun E. coli résistant n'a été détecté. L'administration de ceftiofur a eu un impact limité sur les populations bactériennes composant l'écosystème digestif mais a conduit à une forte sélection et à la diffusion d'un gène plasmidique codant pour une bêta-lactamase à spectre étendu. Puis, dans le cadre de la réglementation visant à diminuer l'expérimentation animale, un modèle in vitro colique porcin, nommé PigutIVM, a été mis au point afin de simuler l'environnement digestif du porcelet et a permis de confirmer, in vitro, l'effet observé in vivo de la colistine sur le microbiote. Cet outil a ensuite été utilisé pour évaluer l'impact d'un probiotique, Saccharomyces cerevisiae, comme alternative aux antibiotiques. Le modèle PigutIVM devrait se positionner comme un outil de prédiction pertinent dans les domaines d'investigation aussi bien nutritionnels que pharmacologiques. In the context of antibiotic resistance, the aim of the current PhD work is to assess the impact of antibiotics on intestinal microbiota of piglets. Two antibiotics i.e. colistin and ceftiofur, for which the main resistances include respectively chromosomal mutations and plasmid genes have been used. Colistin significantly reduced the population of Enterobacteriaceae, but there was no selection of resistant E. coli. The administration of ceftiofur had a limited impact on the bacterial populations that make up the digestive ecosystem but it led to strong selection and dissemination of a plasmid gene encoding an extended-spectrum beta-lactamase. Then, in the framework of regulations to reduce animal testing, an in vitro model of colonic pig named PigutIVM was developed in order to simulate the digestive environment of the piglet and then check the effect of colistin on the microbiota simulated in PigutIVM in vitro. Therefore both the approaches i.e. in vivo and in vitro were compared in order to check the effect of colistin on intestinal microbiota of piglets. This tool was then used to evaluate the impact of a probiotic i.e. Saccharomyces cerevisiae, as alternative to antibiotics. Therefore we assume that this PigutIVM model should be positioned as a relevant predictive tool in the fields of nutritional and pharmacological investigations. Electronic Thesis or DissertationText fr application/pdf1 : 6305 Kohttps://ecm.univ-rennes1.fr/nuxeo/site/esupversions/6d78aee9-27f6-40b8-b276-5f6caa1ab4f0 Fleury Mickaël 1985-10-29 FR 184105676 mickaelfleury1985@gmail.com 2015REN1B002 http://www.theses.fr/2015REN1B002 2015-02-27 Biologie et sciences de la santé Université de Rennes 1thesis.degree.grantor_1 02778715X Doctorat non ouiKempfIsabelleintervenant_1076631168AlricMoniqueintervenant_2076095878 Vie-Agro-SantéecoleDoctorale_1 13908620X Université européenne de BretagnepartenaireRecherche_1 139075119 Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travailpartenaireRecherche_2 184106397 ddc:610 KempfIsabelleAlricMoniqueUniversité de Rennes 1Sciences et technologie, médecine, pharmacie, odontologie, droit, économie, gestion, philosophieVie-Agro-SantéÉcole doctorale Vie-Agro-Santé (Rennes)Université européenne de Bretagne Pôle de recherche et d'enseignement supérieur de Bretagne Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail ASCII PDF 6456746