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| Intérêt de la PCR multiplex Allplex STI Essential dans le diagnostic des infections à Trichomonas vaginalis (Value of the Allplex STI essential PCR panel for the diagnosis of Trichomonas vaginalis infections) | ||
Hamet, Lya - (2024-10-14) / Universite de Rennes - Intérêt de la PCR multiplex Allplex STI Essential dans le diagnostic des infections à Trichomonas vaginalis Langue : Français Directeur de thèse: Gangneux, Jean-Pierre Thématique : Médecine et santé | ||
Mots-clés : Trichomonas vaginalis, Trichomonose, Infection Sexuellement Transmissible, PCR syndromique , Vaginite à Trichomonas, Infections sexuellement transmissibles, Trichomonase , PCR multiplex Résumé : Trichomonas vaginalis est un protozoaire flagellé anaérobie responsable d’infection sexuellement transmissible (IST) qui peut être asymptomatique, sous-diagnostiquée et donc mal prise en charge. La biologie moléculaire a permis d’estimer sa prévalence jusqu’alors peu étudiée et sous-estimée du fait du manque de sensibilité de la microscopie. 41 507 prélèvements pour recherche d’IST ont été analysés au CHU de Rennes entre janvier 2020 et mars 2024 avec le panel Allplex STI Essential (Seegene), détectant T. vaginalis et 6 autres bactéries. Des qPCR spécifiques ciblant le gène de la béta-tubuline ou une région conservée répétée de T. vaginalis ont été réalisées pour étudier la spécificité du panel. Sur l’ensemble des tests effectués, 0.8% étaient positifs à T. vaginalis. La PCR simplex a confirmé la présence d’ADN dans 109/112 cas (97%). 44 patients étaient positifs à T. vaginalis seul et 82 étaient co-infectés avec au moins un germe pathogène détecté par le panel (Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma genitalium). 38% des patients étaient symptomatiques, parmi lesquels 54/128 avaient des symptômes typiques évocateurs de trichomonose. Plus de 60% ont reçu un traitement anti-infectieux, un imidazolé seul ou en association (secnidazole et/ou métronidazole). Nous avons ici décrit l’épidémiologie de 337 patients testés positifs pour T. vaginalis en plus de 3 ans. Le panel Allplex STI Essential est spécifique du parasite, mais certains échantillons mériteraient d’être séquencés afin de vérifier qu’il s’agit bien de T. vaginalis et non pas de T. tenax. Résumé (anglais) : Trichomonas vaginalis is an anaerobic flagellate protozoan responsible for a sexually transmitted infection (STI) which may be asymptomatic, under-diagnosed and therefore poorly treated. Molecular biology has made it possible to estimate its prevalence, which until now had been little studied and underestimated due to the lack of sensitivity of microscopy. 41,507 STI samples were analysed at the University Hospital of Rennes between January 2020 and March 2024 using the Allplex STI Essential panel (Seegene), detecting T. vaginalis and 6 other bacteria. Specific qPCR tests targeting the beta-tubulin gene or a conserved repeat region of T. vaginalis were carried out to study the specificity of the panel. Of all the tests performed, 0.8% were positive for T. vaginalis. Simplex PCR confirmed the presence of DNA in 109/112 cases (97%). 44 patients were positive for T. vaginalis alone and 82 were co-infected with at least one pathogen detected by the panel (Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma genitalium). 38% of patients were symptomatic, of whom 54/128 had typical symptoms suggestive of trichomoniasis. More than 60% received anti-infective treatment with imidazole alone or in combination (secnidazole and/or metronidazole). Here we describe the epidemiology of 337 patients testing positive for T. vaginalis over more than 3 years. The Allplex STI Essential panel is specific for the parasite, but some samples would benefit from sequencing to verify that they are indeed T. vaginalis and not T. tenax. Identifiant : rennes1-ori-wf-1-20175 | ||
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