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| Caractérisation génomique des Entérocoques à Résistance Variable à la Vancomycine (VVE) (Genomic characterization of Vancomycin-Variable Enterococci (VVE)) | ||
Mamou, Zahida - (2020-10-30) / Universite de Rennes 1 - Caractérisation génomique des Entérocoques à Résistance Variable à la Vancomycine (VVE) Langue : Français Directeur de thèse: Cattoir, Vincent Thématique : Médecine et santé | ||
Mots-clés : Enterococcus faecium, vancomycine, VVE, Enterococcus faecium, Vancomycine, Entérocoques Résumé : Depuis une dizaine d’années, des souches particulières d’entérocoques appelées VVE (entérocoques à résistance variable à la vancomycine) au profil atypique ont émergé. Ces souches sont caractérisées par la présence d’une copie silencieuse du gène de résistance vanA et sont par conséquent phénotypiquement sensibles à la vancomycine. Elles ont été décrites dans plusieurs pays tels que la Norvège, le Danemark, le Canada et la Corée du sud. Ce travail de thèse avait pour objectif de décrire les premières souches cliniques françaises de VVE sur plan phénotypique et génomique. Ces souches étaient exclusivement des souches d’E. faecium qui échappaient aux techniques classiques de dépistages par absence de croissance sur milieu sélectif VRE. Sur le plan génomique, la majorité des isolats présentaient une délétion totale ou partielle du système de régulation à deux composants vanRS et/ou de leurs promoteurs associée ou non à l’introduction de séquences d’insertion (IS). Sur l’ensemble des souches étudiées, deux souches ont pu réverter leur susceptibilité à la vancomycine après 48 h à 72 h d’exposition à l’antibiotique. Les souches révertantes présentaient une structure génétique du Tn1546 similaire aux souches VVE initiales cependant leur production du transcrit vanA étaient nettement supérieure. Des études complémentaires sont nécessaires pour comprendre la transcription du gène vanA indépendamment du système de régulation vanRS ainsi que les mécanismes moléculaires qui régissent la réversion en ERV. Résumé (anglais) : In the last decade, peculiar strains of enterococci called VVE (vancomycin-variable enterococci) with an atypical profile have emerged. These strains are characterized by the presence of a silent copy of the vanA gene and are therefore phenotypically susceptible to vancomycin. They have been reported in several countries such as Norway, Denmark, Canada and South Korea. The aim of this study was to describe the first French clinical isolates of VVE. These strains exclusively belonged to the species E. faecium that escaped from conventional screening techniques by absence of growth on VRE-selective medium. The majority of isolates exhibited a total or partial deletion of the two-component regulatory system vanRS and/or their promoters, associated or not with the introduction of insertion sequences (IS). Of all the strains studied, two strains were able to revert to vancomycin resistance after 48 h to 72 h after antibiotic exposure. The revertant strains exhibited a genetic structure of Tn1546 similar to that of initial VVE strains, however their production of the vanA transcript was markedly greater. Further studies are needed to understand the transcription of the vanA gene independently of the vanRS regulatory system as well as molecular mechanisms of reversion to ERV. Identifiant : rennes1-ori-wf-1-14413 | ||
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