5.7. Les applications en microbiologie

Auteur(s) : RECHENMANN FRANCOIS, PARMENTELAT THIERRY    01-06-2015,  01-06-2015  Éditeur(s) :    Description : Une très grande diversité, on l'a vu, d'algorithmes en bio-informatique, motivé par la résolution de problèmes différents. Ces algorithmes, ces recherches en bio-informatique, s'appuient sur des domaines des mathématiques et de l'informatique. De très nombreux domaines sont ainsi impliqués. Je n'en fait pas ici la liste exhaustive mais je vais citer, bien entendu, l'algorithmique en tant que tel sur les chaînes de caractères, nous l'avons vu, mais également sur les arbres, nous l'avons vu, sur les arbres phylogénétiques. Également sur les réseaux, ces réseaux de gènes ou réseaux métaboliques. Probabilité statistique. Nous avons nommé les chaînes de Markov, les modèles de Markov, c'est l'intrusion des probabilités dans la bio-informatique. C'est une des intrusions des probabilités dans la bio-informatique. Les méthodes d'optimisation que nous avons mises en oeuvre, en particulier, pour calculer des alignements optimaux. Les méthodes de satisfaction de contraintes utilisées dans la prédiction des structures d'ARN, par exemple. Des traitements du signal, mais d'autres domaines encore, moins connus de l'informatique, plus abstraits, mais tout aussi utiles, tels que les automates ou les grammaires formelles... Mots-clés libres : génomique, Algorithmique, bioinformatique, biologie cellulaire et moléculaire, Modélisation, arbre phylogénétique Classification générale : Sciences de la vie, Biologie, Biochimie, Ecologie Accès à la ressource : http://www.canal-u.tv/video/inria/5_7_les_applicat... rtmpt://fms2.cerimes.fr:80/vod/fuscia/comment.amel... http://www.canal-u.tv/video/inria/dl.1/5_7_les_app... Conditions d'utilisation : Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs. Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusées sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre originale.

DONNEES PEDAGOGIQUES Type pédagogique : cours / présentation Niveau : enseignement supérieur, licence, licence DONNEES TECHNIQUES Format : video/x-flv Taille : 262.50 Mo Durée d'exécution : 7 minutes 16 secondes

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