<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><metadata>
<lom xmlns="http://ltsc.ieee.org/xsd/LOM" xmlns:lomfr="http://www.lom-fr.fr/xsd/LOMFR" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://ltsc.ieee.org/xsd/LOM http://www.lom-fr.fr/xsd/lomfrv1.0/std/lomfr.xsd">
<general>
    <identifier>
        <catalog>Canal-U_Ocms</catalog>
        <entry>24564</entry>
    </identifier>
    <title><string language="fre"><![CDATA[1.10. Des fenêtres glissantes et recouvrantes]]></string></title>
    <language>FRE</language>
    <description>
        <string language="fre"><![CDATA[Notre sympathique algorithme de balade sur l'ADN, a permis de mettre en évidence des biais de composition de séquences, a fait apparaître sur le tracé un point de rebroussement que l'on peut interpréter comme étant l'origine de réplication. On peut donc être fier d'avoir un algorithme qui serait capable de prédire l'origine de réplication sur un génome bactérien. 
Alors il faut toujours rester très modeste en bio-informatique tout simplement parce qu'on a affaire à des situations biologiques, et que la variabilité des situations biologiques est très élevée. J'en donne pour preuve l'application de ce même algorithme tracé sur le génome de Synechocystis, et vous voyez là un dessin qui ressemble plus aux gribouillis de ma petite fille qu'aux jolis tracés bien interprétables qu'on avait sur Borrelia Burgdoferi. 
Alors ne soyons pas défaitistes pour autant, il faut souligner ici que Synechocystis c'est ce qu'on appelle une "archée-bactérie", c'est-à-dire d'une catégorie de bactéries particulières. Il se trouve que l'algorithme de détection des biais, et donc de l'origine de réplication, marche plutôt bien sur les bactéries. Mais on voudrait le systématiser et c'est-à-dire le rendre non visuel, être capable de faire des prédictions plus quantitatives de cette origine de réplication. Donc nous allons développer un nouvel algorithme qui cette fois-ci va être quantitatif et qui devrait nous permettre, là encore, de détecter ces biais. Il sera légèrement différent. Regardons pourquoi...


ERRATUM
Une erreur a été repérée dans le code de la slide 12 (cf. onglet Erratum pour la correction).]]></string></description>
    <keyword><string language="fre"><![CDATA[génomique]]></string></keyword><keyword><string language="fre"><![CDATA[algorithmique]]></string></keyword><keyword><string language="fre"><![CDATA[bioinformatique]]></string></keyword><keyword><string language="fre"><![CDATA[biologie cellulaire et moléculaire]]></string></keyword><keyword><string language="fre"><![CDATA[modélisation]]></string></keyword>
    <lomfr:documentType>
        <lomfr:source>LOMFRv1.0</lomfr:source>
        <lomfr:value>image en mouvement</lomfr:value>
    </lomfr:documentType>
</general><lifeCycle>
    
    <contribute>
            <role>
                <source>LOMv1.0</source>
                <value>author</value>
            </role>
            <entity><![CDATA[BEGIN:VCARD
VERSION:3.0
CLASS:PUBLIC
REV:2016-10-30 00:01:09
FN:Francois RECHENMANN
N:RECHENMANN;Francois;;;

URL;TYPE=work:http://www.canal-u.tv/auteurs/rechenmann_francois
ROLE:author
NOTE:  Ingénieur et Docteur-Ingénieur en informatique, François Rechenmann est chercheur au centre Inria Grenoble – Rhône-Alpes. Il y exerce ses activités à l’interface de l’informatique et des sciences du vivant en contribuant plus particulièrement au développement de méthodes et de logiciels pour l’analyse des séquences génomiques des microorganismes. Cofondateur de la société Genostar, qui propose des solutions bioinformatiques aux industries pharmaceutiques, agroalimentaires et biotechnologiques, il en est le conseiller scientifique. Très impliqué dans les actions de médiation scientifique, François Rechenmann est le responsable scientifique du site Interstices dont l’objectif est d’expliquer l’informatique en tant que domaine de recherche.   
TZ:+0200
END:VCARD
]]></entity>
            <date><dateTime>2015-06-01</dateTime></date>
        </contribute>

    <contribute>
            <role>
                <source>LOMv1.0</source>
                <value>author</value>
            </role>
            <entity><![CDATA[BEGIN:VCARD
VERSION:3.0
CLASS:PUBLIC
REV:2016-10-30 00:01:09
FN:Thierry PARMENTELAT
N:PARMENTELAT;Thierry;;;

URL;TYPE=work:http://www.canal-u.tv/auteurs/parmentelat_thierry
ROLE:author
NOTE:Thierry Parmentelat a mené une carrière hybride entre les mondes   académique et industriel. Ses centres d'intérêt couvrent les langages de   programmation, les réseaux, et l'algèbre. Actuellement ingénieur de   recherche chez Inria, Thierry Parmentelat utilise Python depuis plus de   10 ans pour ses travaux de recherche, ainsi que pour le développement   des plateformes expérimentales dont il a la charge. 
TZ:+0200
END:VCARD
]]></entity>
            <date><dateTime>2015-06-01</dateTime></date>
        </contribute>

</lifeCycle>
<metaMetadata>
    <metadataSchema>LOMv1.0</metadataSchema>
    <metadataSchema>LOMFRv1.0</metadataSchema>
</metaMetadata>
<technical>
    <format>video/x-flv</format>
    <location><![CDATA[http://www.canal-u.tv/video/inria/1_10_des_fenetres_glissantes_et_recouvrantes.24564]]></location>
    <location><![CDATA[rtmpt://fms2.cerimes.fr:80/vod/fuscia/des.fenetres.glissantes.et.recouvrantes_24564/c016fr.w1.s10.fr.mp4]]></location>
        <location><![CDATA[http://www.canal-u.tv/video/inria/dl.1/1_10_des_fenetres_glissantes_et_recouvrantes.24564]]></location>
        
    <size>260475688</size>
    <duration><duration>PT0H6M45S</duration></duration>
</technical>
<educational>
    <learningResourceType>
        <source>LOMv1.0</source>
        <value>lecture</value>
    </learningResourceType>
    
    <context>
        <source>LOMv1.0</source>
        <value>higher education</value>
    </context>
    <context>
        <source>LOMv1.0</source>
        <value>licence</value>
    </context>
    <context>
        <source>LOMv1.0</source>
        <value>licence</value>
    </context>
</educational>
<rights>
    <cost>
        <source>LOMv1.0</source>
        <value>no</value>
    </cost>
    <copyrightAndOtherRestrictions>
        <source>LOMv1.0</source>
        <value>no</value>
    </copyrightAndOtherRestrictions>
    <description>
        <string language="fre"><![CDATA[Droits réservés à l'éditeur et aux auteurs. 
Ces ressources de cours sont, sauf mention contraire, diffusées sous Licence Creative Commons. L’utilisateur doit mentionner le nom de l’auteur, il peut exploiter l’œuvre sauf dans un contexte commercial et il ne peut apporter de modifications à l’œuvre originale.]]></string>
    </description>
</rights>

            <relation>
                <kind>
                    <source>LOMv1.0</source>
                    <value>ispartof</value>
                </kind>
                <resource>
                    <identifier>
                        <catalog>URI</catalog>
                        <entry>http://www.canal-u.tv/producteurs/inria/cours_en_ligne/bioinformatique_algorithmes_et_genomes/adn_et_sequences_genomiques</entry>
                    </identifier>
                    <description>
                        <string language="fre"><![CDATA[1. ADN et séquences génomiques]]></string>
                    </description>
                </resource>
            </relation>

<classification>
    <purpose>
        <source>LOMv1.0</source>
        <value>discipline</value>
    </purpose>
    <taxonPath>
        <source>
        <string language="fre"><![CDATA[Universités Numériques Thématiques 2009 http://www.universites-numeriques.fr]]></string>
        </source>
        <taxon>
            <id/>
            <entry>
                <string language="fre"/>
            </entry>
        </taxon>
    </taxonPath>
</classification>
<classification>
    <purpose>
        <source>LOMv1.0</source>
        <value>discipline</value>
    </purpose>
    
    <taxonPath>
        <source>
            <string language="fre">CDD 22e éd.</string>
            <string language="eng">DDC 22nd ed.</string>
        </source>
        <taxon>
            <id>570.285</id>
            <entry>
                <string language="fre"><![CDATA[biologie application informatique]]></string>
            </entry>
        </taxon>
   </taxonPath>
</classification>      </lom>
   </metadata>