| Étude rétrospective sur l’apport d’une technique diagnostique de biologie moléculaire dans la gestion de l’antibiothérapie des infections respiratoires basses dans le service de Réanimation Polyvalente de l’hôpital de Lorient (Retrospective study on the contribution of a molecular biology diagnostic method on antibiotic stewardship of lower respiratory tract infections in the intensive care unit of the general hospital of Lorient) | ||
Le Gall, Ylan - (2021-10-08) / Universite de Rennes 1 - Étude rétrospective sur l’apport d’une technique diagnostique de biologie moléculaire dans la gestion de l’antibiothérapie des infections respiratoires basses dans le service de Réanimation Polyvalente de l’hôpital de Lorient Langue : Anglais Directeur de thèse: Caubel, Antoine Thématique : Médecine et santé | ||
Mots-clés : Réanimation, infection respiratoire, infection associée aux soins, PCR multiplex, adaptation antibiothérapie, Appareil respiratoire--Infections , Antibiothérapie, PCR (génétique) , Diagnostic biologique Résumé : Contexte - Les infections respiratoires basses, communautaires et nosocomiales, sont fréquentes en service de soins intensifs et occasionnent une morbidité et une mortalité importantes. Les techniques diagnostiques basées sur la PCR multiplex syndromique pourraient représenter un intérêt dans la gestion de l’antibiothérapie de telles infections. Matériels et méthodes - Étude rétrospective monocentrique de tous les adultes hospitalisés en réanimation au centre hospitalier de Lorient au cours de deux périodes successives d’un an, du 1er juin 2018 au 31 mai 2019 et du 1er juin 2019 au 31 mai 2020, présentent une infection respiratoire basse communautaire ou nosocomiale et ventilés. Les prélèvements respiratoires étaient analysés en microbiologie standard au cours des deux périodes et en association à la PCR multiplex dans la seconde. Nous avons comparé les types d’adaptation au cours des deux périodes. Résultats 121 patients et 150 prélèvements respiratoires ont été inclus dans l’analyse finale (âge médian 66 ans ; 71% d’homme ; IGSII médian 50). Les patients recevaient une antibiothérapie probabiliste dans 89% des cas. La prévalence et l’incidence de modification du traitement anti-infectieux après prélèvement respiratoire étaient supérieures au cours de la première période (p<0.003 et log-rank, p=0.002 respectivement). Cette différence s’observait lors de l’augmentation de spectre antibiotique (log-rank, p<0.001) mais pas lors de sa décroissance (log-rank, p=0.6). En analyse multivariée, la présence d’une antibiothérapie probabiliste en réanimation (régression HR 0.32, 95%IC 0.17-0.61, p = 0.0003) et une admission au cours de la période où la PCR multiplex était utilisée en routine (régression HR 0.43, 95%IC 0.23-0.81, p=0.0087) étaient associées à une moindre modification d’antibiothérapie. En analyse multivariée, l’utilisation de la PCR multiplex n’était pas indépendamment associée à la modification de traitement (régression HR 0.54, 95%IC 0.26-1.10, p=0.091). Conclusion Nos données rapportent que l’utilisation de la PCR multiplex autorise une décroissance antibiotique comparable à celle de la microbiologie standard et entraine peu d’élargissement d’antibiothérapie. Néanmoins les données sont insuffisantes pour montrer un effet positif de la PCR multiplex sur le délai d’adaptation de l’antibiothérapie. Résumé (anglais) : Background Community or healthcare-associated pneumonia is common in intensive care units (ICU). Morbidity and mortality remain of concern worldwide. The use of a molecular biology diagnostic tool as syndromic multiplex PCR is attractive and might be of interest in the antibiotic stewardship of such infections. Materials and methods Retrospective, monocentric study of all adults hospitalized in intensive care unit (ICU) at the District Hospital of Lorient during two consecutive one-year periods, from 1 June 2018 to 31 May 2019 and from 1 June 2019 to 31 May 2020 respectively, with at least one episode of community or healthcare-associated pneumonia requiring mechanical ventilation. Respiratory samples were analyzed in standard microbiology during both periods and in association with multiplex PCR exclusively during the second one. We compared antibiotic modification and their types between periods. Results One hundred and twenty-one patients and 150 respiratory samples were included in the final analysis (median age 66 years ; 71% male ; median SAPSII 50). A probabilistic antibiotic was prescribed in ICU in 89% of pneumonia episodes. Prevalence and incidence of treatment modifications after respiratory sampling was higher during the first period (p<0.003 and log-rank, p=0.002). That difference was significant concerning the incidence of spectrum enlargement (log rank, p<0.001) but not when it was narrowed (log rank, p=0.6). In multivariate analysis, first administration of antibiotic in ICU (regression HR 0.32, 95%IC 0.17-0.61, p=0.0003) and being hospitalized during the second period (regression HR 0.43, 95%IC 0.23-0.81, p=0.0087) were significantly associated with fewer treatment modifications. In multivariate analysis, the use of multiplex PCR was not independently associated with treatment modification (regression HR 0.54, 95%IC 0.26-1.10, p=0.091). Conclusion In our study, the use of multiplex PCR allowed antibiotic de-escalation in proportions close to standard microbiology and a low incidence of spectrum enlargement. However we failed to show a positive effect of the multiplex PCR on the time to antibiotic adjustment. Identifiant : rennes1-ori-wf-1-15813 | ||
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